Нематодофауна нативных популяций европейской корюшки включает 20 видов нематод. Наиболее разнообразна нематодофауна проходной (морской) формы корюшки – 14 видов. Нематодофауна озерной корюшки включает 8 видов. Нематодофауна снетка насчитывает 3 вида нематод. Нематодофауна интодуцированных популяций корюшки бедна. В оз. Сегозере у корюшки зарегистрирован 1 вид – нематода лососеобразных Cystidicola farionis. В оз. Выгозере 2 вида - Cystidicola farionis и Camallanus lacustris. В оз.Сямозере 3 вида - Camallanus lacustris, C. truncatus, Raphidascaris acus. Мониторинговые наблюдения за паразитофауной корюшки, спонтанно вселившейся в оз. Сямозеро, показали, что аборигенные виды нематод осваивают чужеродного хозяина в течение 10 лет.